Virus Entèrics (SAVCA)

Virus Entèrics (SAVCA)

El Grup de Virus Entèrics pertany al Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística (Secció de Microbiologia, Virologia i Biotecnologia) i ha estat reconegut com a Grup Consolidat de Recerca des de 1998 (2021 SGR 01089), i com a grup pre-TECNIO per la UB. El grup està co-liderat pel Dr Albert Bosch i la Dra Rosa M Pintó i actualment consta d’una professora agregada, una professora lectora, 2 tècnics doctors responsables del sistema de qualitat, 4 estudiants de doctorat i un tècnic. El laboratori té les instal·lacions principals a la Facultat de Biologia (Campus Diagonal), però centralitza una gran part de les seves activitats de transferència i assessorament cap al sector privat i les administracions en el Laboratori SAVCA (Servei d’Anàlisi de Virus a la Cadena Alimentària i Cicle de l’Aigua), ubicat al Campus de l’Alimentació de Torribera.

Rosa M Pintó
Investigador principal
Rosa M Pintó

Rosa Maria Pintó, Catedràtica de Microbiologia i coordinadora del grup SGR de Virus Entèrics, té més de 35 anys d’experiència en Virologia. Va llegir la Tesi doctoral l’any 1990 sobre una malatia vírica del llobarro i va obtenir el Premi Extraordinari de Doctorat. Posteriorment, va fer una estada post-doctoral a l’Institut de Virologia d’Oxford on va treballar amb baculovirus recombinants. Ja de tornada a Barcelona va començar a treballar amb virus entèrics humans, en especial amb el virus de la hepatitis A i astrovirus. La seva trajectòria es caracteritza per estudiar la biologia molecular d’aquests virus i traslladar els coneixements en aspectes aplicats com són la epidemiologia ambiental, i la seguretat alimentaria. En aquest últim aspecte cal destacar que el grup de Virus Entèrics ha establert un laboratori de serveis per l’anàlisi de virus en la cadena alimentaria i cicle de l’aigua (SAVCA). Al llarg de tots aquests anys ha publicat més de 140 articles en revistes científiques catalogades al WOS, 27 capítols de llibres i té dues patents PCT en explotació per l’empresa francesa BioMérieux. Amb més de 5.550 citacions (WOS) d’altres científics, té un índex h (WOS) de 45. A més s’ha situat en la posició 1.754 del Rànquing 2023 d’investigadors d’Espanya i d’espanyols a l’estranger (123.400), situant-la entre el 2% dels investigadors espanyols més citats (Google Scholar Citations public profiles 2023). També es troba a la posició 302 del Rànquing de dones investigadores d’Espanya i d’espanyoles a l’estranger (11.394).

https://orcid.org/0000-0003-1382-6648
Equip
Línies de recerca
  • Biologia Molecular de virus de les hepatitis A (HAV) i E (HEV)
    • Desenvolupament i caracterització de nous candidats vacunals per a hepatitis A
    • Desenvolupament d’organoids humans per a estudis d’interacció virus-hoste HEV
  • Biologia Molecular d’Astrovirus
    • Entendre les bases moleculars de la disseminació extraintestinal i neurotropisme utilitzant organoids humans
  • Epidemiologia molecular de virus basada en seqüenciació massiva i filogènia
    • Caracterització de brots d’hepatitis A i gastroenteritis
    • Tipatge molecular i caracterització de variants
    • Quantificació de genomes vírics
  • Epidemiologia Basada en Aigües Residuals (WBE)
    • Vigilància de virus emergents i coneguts: SARS-CoV2, Enterovirus, influenza, RSV, etc
  • Seguretat Vírica d’Aliments i Aigua (Laboratori SAVCA)

    Servei de detecció norovirus i hepatitis A segons protocol ISO 15216-2:2019

    Desenvolupament de mètodes moleculars per estimar títols infecciosos de virus no cultivables

  • Estudis Virològics per al Sector Farmacèutic
    • Transferència soques vacunals
    • Seguretat vírica en productes medicamentosos
    • Producció de materials d’interès biotecnològic com a virus control de procés
    • Serveis de validació kits de diagnòstic virològic

Garcia-Pedemonte D, Carcereny A, Gregori J, Quer J, Garcia-Cehic D, Guerrero L, Ceretó-Massagué A, Abid I, Bosch A, Costafreda MI, Pintó RM, Guix S.

Comparison of Nanopore and Synthesis-Based Next-Generation Sequencing Platforms for SARS-CoV-2 Variant Monitoring in Wastewater

Int J Mol Sci. 2023 Dec 6;24(24):17184. ; DOI: https://doi.org/10.3390/ijms242417184

Costafreda MI, Sauleda S, Riveiro-Barciela M, Rico A, Llorens-Revull M, Guix S, Pintó RM, Bosch A, Rodríguez-Frías F, Rando A, Piron M, Bes M.

Specific Plasma MicroRNA Signatures Underlying the Clinical Outcomes of Hepatitis E Virus Infection

Microbiol Spectr. 2023 Feb 14;11(1):e0466422. ; DOI: https://doi.org/10.1128/spectrum.04664-22

Guerrero-Latorre L, Collado N, Abasolo N, Anzaldi G, Bofill-Mas S, Bosch A, Bosch L, Busquets S, Caimari A, Canela N, Carcereny A, Chacón C, Ciruela P, Corbella I, Domingo X, Escoté X, Espiñeira Y, Forés E, Gandullo-Sarró I, Garcia-Pedemonte D, Girones R, Guix S, Hundesa A, Itarte M, Mariné-Casadó R, Martínez A, Martínez-Puchol S, Mas-Capdevila A, Mejías-Molina C, Rafa MMI, Munné A, Pintó RM, Pueyo-Ros J, Robusté-Cartró J, Rusiñol M, Sanfeliu R, Teichenné J, Torrell H, Corominas L, Borrego CM.

The Catalan Surveillance Network of SARS-CoV-2 in Sewage: design, implementation, and performance

Sci Rep. 2022 Oct 6;12(1):16704. ; DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-022-20957-3

Carcereny A, Martínez-Velázquez A, Bosch A, Allende A, Truchado P, Cascales J, Romalde JL, Lois M, Polo D, Sánchez G, Pérez-Cataluña A, Díaz-Reolid A, Antón A, Gregori J, Garcia-Cehic D, Quer J, Palau M, Ruano CG, Pintó RM, Guix S.

Monitoring Emergence of the SARS-CoV-2 B.1.1.7 Variant through the Spanish National SARS-CoV-2 Wastewater Surveillance System (VATar COVID-19)

Environ Sci Technol. 2021 Sep 7;55(17):11756-11766.; DOI: https://doi.org/10.1021/acs.est.1c03589

Pintó RM, Pérez-Rodríguez FJ, Costafreda MI, Chavarria-Miró G, Guix S, Ribes E, Bosch A.

Pathogenicity and virulence of hepatitis A virus

Virulence. 2021 Dec;12(1):1174-1185.; DOI: https://doi.org/10.1080/21505594.2021.1910442

Fuentes C, Pérez-Rodríguez FJ, Sabrià A, Beguiristain N, Pintó RM, Guix S, Bosch A.

Inactivation of Hepatitis A Virus and Human Norovirus in Clams Subjected to Heat Treatment

Front Microbiol. 2021 Jan 12;11:578328.; DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.578328

Anfruns-Estrada E, Sabrià A, Fuentes C, Sabaté S, Razquin E, Cornejo T, Bartolomé R, Torner N, Izquierdo C, Soldevila N, Coronas L, Dominguez A, Pintó RM, Bosch A, Guix S

Detection of Norovirus in Saliva Samples from Acute Gastroenteritis Cases and Asymptomatic Subjects: Association with Age and Higher Shedding in Stool

Viruses. 2020 Nov 30;12(12):1369. ; DOI: https://doi.org/10.3390/v12121369

Guix S, Fuentes C, Pintó RM, Blanco A, Sabrià A, Anfruns-Estrada E, Garrido VR, Alonso M, Bartolomé R, Cornejo T, Pumarola T, Bosch A.

Infectivity of Norovirus GI and GII from Bottled Mineral Water during a Waterborne Outbreak, Spain

Emerg Infect Dis. 2020 Jan;26(1):134-137. ; DOI: https://doi.org/10.3201/eid2601.190778

Vu DL, Bosch A, Pintó RM, Ribes E, Guix S.

Human Astrovirus MLB Replication In Vitro: Persistence in Extraintestinal Cell Lines.

J Virol. 2019 Jun 14;93(13):e00557-19.; DOI: https://doi.org/10.1128/JVI.00557-19

Guix S, Pintó RM, Bosch A.

Final Consumer Options to Control and Prevent Foodborne Norovirus Infections

Viruses. 2019 Apr 9;11(4):333. ; DOI: https://doi.org/10.3390/v11040333

Sabrià A, Gregori J, Garcia-Cehic D, Guix S, Pumarola T, Manzanares-Laya S, Caylà JA, Bosch A, Quer J, Pintó RM.

Evidence for positive selection of hepatitis A virus antigenic variants in vaccinated men-having-sex-with men patients: Implications for immunization policies

EBioMedicine. 2019 Jan;39:348-357. ; DOI: https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2018.11.023

Understanding Dissemination of Emerging Enteric Viruses beyond the Intestinal Tract Using human Organoids (DissEntVIRUS) - PID2021-124023OB-I00

Susana Guix/Rosa M Pintó

2022-2025

L’intestí és la superfície mucosa més gran del cos i una barrera física que protegeix l’hoste de nombrosos patògens. La infecció de l’hoste per virus entèrics de transmissió fecal-oral comença amb la replicació viral a les cèl·lules susceptibles de l’epiteli intestinal, però es pot disseminar posteriorment cap a altres òrgans. L’objectiu principal d’aquest projecte és comprendre millor com s’alliberen els virus de les cèl·lules intestinals infectades i els principals determinants vírics i de l’hoste que participen en la difusió des de l’intestí cap a altres òrgans.

 

Improving methods for the assessment of infectious human enteric virus survival in produce (MASSIVE) - CPS2024

Susana Guix

2024-2025

Els aliments vegetals es poden contaminar ocasionalment per virus humans i provocar casos esporàdics de malalties i brots a la comunitat. Els virus associats amb més freqüència a malalties del consum de productes són els norovirus humans i el virus de l’hepatitis A, que poden causar gastroenteritis i hepatitis agudes, respectivament. La detecció de virus en aliments com ara verdures de fulla verda i fruits vermells és un repte perquè la contaminació sol produir-se en quantitats baixes i els mètodes disponibles proporcionen informació sobre la contaminació per genomes virals, que no sempre indiquen un risc real d’infecció. Aquest projecte pretén optimitzar els mètodes actuals de concentració i detecció de norovirus i hepatitis A en els productes vegetals per augmentar-ne l’eficiència, reduir-ne el temps de resposta i proporcionar estimacions de la infectivitat viral i el risc d’infecció. També s’implementaran els mètodes optimitzats per aportar informació sobre la persistència de virus infecciosos en verdures de fulla verda i fruits vermells durant els escenaris d’emmagatzematge i desinfecció posterior a la collita.

 

Nova vacuna per l'hepatitis A basada en una soca vírica de replicació ràpida i en un nou sistema de presentació antigènica - 2021PROD00178

Rosa M Pintó

2022-2024

Surveillance of Emerging Pathogens and Antibiotic Resistances in Aquatic Ecosystems (SARA) - PCI2021-121928

Anicet Blanch

2021-2024

Vacuna per a l'hepatitis A de segona generació: ús d'una soca de replicació ràpida en cèl·lules Vero encapsulada en vesícules immunopotenciadores - F2I-PdC_2023-009

Maria I Costafreda

2024

Standardized method and kit for the quantification of Hepatitis A virus

PCT/EP2007/055402

2007

Control for assays based on reverse-transcription polymerase chain reaction

PCT/EP2007/055407

2007

Sortida del virus de l’hepatitis A dels hepatòcits: implicacions en la selecció d’antivirals

Director/es: Rosa M Pintó i Albert Bosch

 

2018

Epidemiologia molecular dels brots de gastroenteritis per norovirus i d’hepatitis A: de la seqüència consens a la quasiespècie

Director/es: Rosa M Pintó i Susana Guix

2018

Foodborne viruses: a new food safety challenge

Università degli Studi di Bari Aldo Moro

Director/es: Vitto Martella i Susana Guix

2019

Characterization of emerging novel human astrovirus: from bedside to bench

Director/es: Susana Guix i Albert Bosch

2020

Detección y caracterización de virus emergentes en su ciclo ambiental

Director/es: Albert Bosch i Rosa M Pintó

2021

Millores en la detecció molecular de virus en aigües i aliments

Director/es: Albert Bosch i Susana Guix

2022

Impacte i control dels brots de gastroenteritis per norovirus a Catalunya (2017-2019), i estudi de la presència del virus a la saliva

Director/es: Susana Guix i Albert Bosch

2022

Del cicle biològic a noves estratègies vacunals pel virus de l’hepatitis A 

Director/es: Rosa M Pintó i Maria I Costabreda

2023